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南方医科大学珠江医院老师团队 BMJ 子刊(IF=10.6)重磅发文:单细胞多组学破解免疫治疗结肠炎

来源:特诺科研

免疫检查点阻断(ICB)是癌症治疗的 利器,但 BMJ 子刊《Journal for ImmunoTherapy of Cancer》(IF=10.6)最新研究显示,高达 25% 的患者会出现免疫相关结肠炎(irColitis),严重者需停药。南方医科大学珠江医院、南方医院团队通过单细胞多组学技术,首次锁定irColitis 的核心致病细胞 ——IFNG+IL17+CD4+ T 细胞,并揭示巨噬细胞分泌的IL-23 与 CXCL9/10 是其 推手,为 ICB 治疗保疗效、控副作用” 提供了精准方案!


文章信息速览

  • 原标题Single-cell multiomics reveals macrophage-derived IL-23 and CXCL9/10 drive pathogenic IFNG+IL17+ T cells in immunotherapy-related colitis

  • 期刊Journal for ImmunoTherapy of CancerBMJ 子刊,IF=10.6

  • 关键词:免疫检查点阻断(ICB)、免疫相关结肠炎(irColitis)、单细胞多组学、IFNG+IL17+CD4+ T 细胞、IL-23CXCL9/10、巨噬细胞

研究目的

ICB 相关 irColitis 是临床亟待解决的 痛点:传统激素治疗应答率低,且可能削弱抗癌效果。本研究旨在:

用单细胞多组学解析 irColitis 肠道微环境的细胞异质性,锁定核心致病细胞;

阐明致病细胞的分化与调控机制;

验证靶向干预的疗效及对 ICB 抗肿瘤作用的影响。

核心研究亮点

1. 单细胞多组学锁定 irColitis 特异性致病 细胞(图 1-2

大样本细胞图谱:分析 180 份样本的 868,138 个单细胞,注释出 12 类核心细胞群,其中IFNG+IL17+CD4+ T 细胞在 irColitis 组织中占比达 18.7%,而正常组织 溃疡性结肠炎组织中不足 3%(图 1J-K),且该细胞同时表达 Th1IFNG)、Th17IL17A)特征基因(图 2A)。


图1

分化起源:细胞速度与拟时序分析证实,该致病细胞由肠道组织驻留记忆 T 细胞(TRM)分化而来,分化中干细胞标志物(IL7RTCF7)下调,炎症因子表达升高(图 2F-H);小鼠模型中,TRM 细胞比例显著降低(图 2E),印证临床结果。


图2


图3

3. CXCL9/10-CXCR3 轴介导巨噬细胞 致病 细胞通讯(图 4-5

细胞通讯网络:CellChat 分析显示,irColitis 中巨噬细胞与 IFNG+IL17+CD4+ T 细胞的 CXCL9/10-CXCR3 信号强度是正常组织的 倍(图 4F-G),空间转录组证实二者在病灶共定位(图 4L-M)。


图4


功能验证:阻断 CXCL9/10 或 CXCR3 后,小鼠结肠炎症缓解(图 5B-C),IFNG+IL17+CD4+ T 细胞比例降低 38%,且仅抑制 IFN-γ 表达(图 5F),明确该轴调控致病细胞的 IFN-γ 分泌。


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4. 巨噬细胞是核心调控枢纽,靶向耗竭安全有效(图 6

巨噬细胞亚群特征:irColitis 中促炎性 M0 样巨噬细胞(Macrophage 1)占比从 12% 升至 35%,该亚群高表达 CXCL9CXCL10 及 IL23A,糖酵解活性异常升高(图 6C-EH)。

耗竭实验:氯膦酸脂质体耗竭巨噬细胞后,小鼠 DAI 评分降至 1.0(图 6J),肠道 CXCL9/10IL23A 表达下降 50%IFNG+IL17+CD4+ T 细胞比例同步降低(图 6L)。


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安全性验证:结直肠癌 ICB 应答患者肿瘤组织中,IFNG+IL17+CD4+ T 细胞比例与治疗应答无关(图 7D-I);且肿瘤中 IL23A 表达远低于 irColitis 组织(图 6N),提示靶向巨噬细胞不影响 ICB 疗效。


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5. IL-23 与 CXCL9/10 协同驱动致病细胞分化(图 5

体外机制:IL-23 促进 Th17 前体细胞增殖(CFSE 增殖指数升 2.3 倍),CXCL9/10 驱动其向 IFNG+IL17 + 双阳性细胞分化(图 6N);联合阻断 IL-23 与 CXCR3,较单一阻断更显著降低致病细胞比例(65% vs 38%-42%),小鼠 DAI 进一步下降(图 5S)。

核心机制闭环

ICB 激活肠道免疫后,促炎性巨噬细胞分泌 IL-23(促进 TRM 分化为致病性 Th17)与 CXCL9/10(驱动 Th17 表达 IFN-γ),最终形成 IFNG+IL17+CD4+ T 细胞引发炎症;靶向巨噬细胞、IL-23 或 CXCL9/10-CXCR3 轴,可在抑制 irColitis 的同时保留 ICB 的抗癌效果(图 5T)。

这篇研究的多组学设计精准踩中科研热点 + 逻辑闭环:

从选题角度,锚定 免疫治疗相关结肠炎(irColitis” 这一临床刚需方向,同时聚焦 “IFNG+IL17+CD4+ T 细胞 巨噬细胞” 这两个当前免疫领域的热点细胞群,既解决临床痛点,又贴合领域研究趋势;

从技术组合看,单细胞 RNA-seq+TCR 测序 空间转录组” 的多组学搭配,既用单细胞解析细胞异质性,又通过TCR 测序明确致病细胞的抗原特异性,再用空间转录组补全细胞的 位置 功能” 关联,技术链完整且层层递进;更巧妙的是,后续用 抗体阻断 巨噬细胞耗竭” 的体内实验验证组学发现,让 组学筛选 功能验证” 形成闭环,避免了纯组学研究的 空泛” 问题。

从可复现性来说,研究中部分单细胞数据可通过公共数据库获取,核心验证实验(流式、qPCR、抗体阻断)是常规实验室能开展的技术,哪怕没有组学平台的课题组,也能借鉴 公共组学数据小样本功能验证” 的思路,降低了研究门槛。

这种临床问题多组学筛靶标体内外功能验证” 的多组学范式,既容易产出高分成果,又具备临床转化潜力,非常适合想做 从组学到功能” 研究的团队参考。

原文DOI: 10.1136/jitc-2025-011959

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