食管鳞状细胞癌（ESCC）是亚洲高发恶性肿瘤，5 年生存率仅 10%-30%，肿瘤内 / 间异质性显著导致早诊难、治疗手段有限，精准诊疗靶点匮乏成为临床核心痛点。近日，郑州大学团队在《Protein & Cell》（IF=12.8，生物领域顶刊，0 版面费开源获取）发表重磅综述研究，整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等多组学技术，结合单细胞测序与实验验证，全面解析 ESCC 分子特征、肿瘤异质性及核心调控通路，还明确了多组学在 ESCC 诊断、预后、治疗中的临床转化价值，为食管鳞癌精准诊疗提供全新思路！医生朋友想发高分区多组学顶刊论文，专业论文服务就找我们，全程助力从实验设计、数据整合到发文落地，轻松攻克多组学发文难题。

文章信息速览

• 原标题：Advances in multi-omics for esophageal squamous cell carcinoma: Diagnostic, prognostic, and therapeutic perspectives
  

• 期刊：Protein & Cell（IF=12.8，生物领域顶刊，0 版面费开源获取，遵循 CC BY 4.0 协议）

• 关键词：食管鳞状细胞癌、高通量组学、基因组、转录组、代谢组、蛋白质组、诊断标志物、预后标志物、治疗靶点、肿瘤微环境

研究背景与临床痛点

患病现状严峻：ESCC 占全球食管癌发病的 90%，亚洲为高发区域，5 年生存率仅 10%-30%，手术切除为主要根治手段，但局部晚期患者术后易复发、远处转移，预后极差。

精准诊疗困境：ESCC 肿瘤内 / 间异质性突出，缺乏特异性早诊标志物，传统放化疗、免疫治疗未结合患者分子特征制定个性化方案，治疗响应率低。

技术应用短板：单一组学技术仅能揭示肿瘤某一层面的分子变化，无法系统解析 ESCC 发生发展的完整机制，而多组学整合分析的标准化流程尚未建立。

临床转化障碍：多组学在 ESCC 中的研究虽有进展，但因样本质量参差不齐、多中心验证不足、数据整合难度大，难以落地常规临床诊疗工作。

研究核心亮点

这篇 IF=12.8 顶刊综述，完美契合生物领域顶刊对多组学研究的审稿偏好，从临床痛点切入→单组学分层解析→多组学整合创新→临床转化落地→展望领域未来的五步逻辑，成为医生发表多组学顶刊论文的绝佳范本，关键结果均以可视化图表支撑（图 1-6），让研究核心一目了然：

第一步：锚定临床痛点，单组学分层解析分子特征，夯实研究基础（图 1、2）

发文技巧：从临床高发肿瘤的诊疗痛点切入，先通过单组学技术解析核心分子特征，结合公共数据库交叉验证，为多组学整合奠定坚实基础，同时用示意图清晰展示分子调控通路和公共数据集分布，让审稿人快速抓住研究核心。关键结果：

基因组层面：通过全基因组 / 外显子测序，明确 TP53、NOTCH1、FAT1 等为 ESCC 高频突变基因，RTK/RAS、PI3K/AKT、Wnt 等为核心致癌通路，绘制出 ESCC 基因组全景图谱（图 1）。

图1

转录组层面：整合 GEO 公共数据集，系统解析 mRNA、lncRNA、miRNA、circRNA 等多 RNA 层表达特征，筛选出 ANO1、MMP3、PLEK2 等与 ESCC 预后密切相关的基因（图 2）。

图2

第二步：多组学横向整合，跨维度挖掘分子关联，打造研究核心创新点（图 3、4）

发文技巧：单一组学研究难以登上顶刊，需通过单细胞测序（scRNA-seq）整合多组学数据，同时结合蛋白翻译后修饰（PTMs）分析，跨维度挖掘分子间调控关系，突出研究的系统性和创新性，用流程示意图展示技术路线和核心发现。关键结果：

单细胞测序整合多组学：解析出 ESCC 肿瘤微环境的免疫抑制特征，发现 CST1⁺肌成纤维细胞与患者不良预后相关，还明确了肿瘤细胞与微环境的复杂通讯网络（图 3）。

图3

蛋白翻译后修饰分析：总结出磷酸化、糖基化、乙酰化是 ESCC 的关键蛋白调控方式，为后续靶点挖掘提供了全新方向（图 4）。

图4

第三步：聚焦临床转化，多组学锚定诊疗标志物与治疗靶点，实现研究价值落地（图 5）

发文技巧：顶刊高度重视研究的临床意义，多组学分析后需进一步锚定可转化的诊断 / 预后标志物和可用药治疗靶点，搭建多组学分析 - 分子特征 - 临床应用的完整逻辑链，用示意图清晰展示转化路径。关键结果：

诊断 / 预后标志物：筛选出 PAX9、SIM2 等甲基化早诊标志物，以及 CCND1、SOX2 等预后相关基因，为 ESCC 早筛和预后评估提供了特异性指标。

潜在治疗靶点：明确 PIK3CA、EGFR、HER2 等为 ESCC 可用药靶点，还通过多组学分析实现 ESCC 分子亚型分类，为患者分层治疗提供依据（图 5）。

图5

第四步：直面研究挑战，提出解决方案与未来方向，提升研究深度与前瞻性（图 6）

发文技巧：高质量多组学文章不仅要解析领域现状，还需客观分析研究中存在的挑战，并提出针对性解决方案和未来研究方向，体现研究的前瞻性和深度，契合顶刊的审稿要求。关键结果：

指出领域挑战：ESCC 多组学研究存在样本匮乏、肿瘤异质性大、分析流程不标准、多中心验证不足等问题。

提出未来方向：建议将人工智能与多组学数据结合，提升数据整合效率；开展大样本多中心研究，推动多组学成果向临床常规诊疗落地（图 6）。

图6

从顶刊力作看：医生如何发表高质量多组学文章？

结合郑州大学团队这篇 IF=12.8 顶刊研究，从选题、技术、数据、图表、临床转化5 个核心维度，为临床医生梳理多组学文章的发文思路，避开发文误区，精准契合顶刊偏好：

1. 选题：紧扣临床痛点，拒绝 “纯数据堆砌”

多组学研究选题需围绕临床未解决的核心问题展开，如 ESCC 的早诊难、靶点匮乏、异质性大等，让研究始终服务于临床，避免脱离临床的纯基础组学数据解析，这样的研究更易获得顶刊认可。

2. 技术：单组学为基，多组学为核，结合实验验证

单一组学技术难以支撑高分区论文，建议采用单组学分层解析 + 多组学整合分析 + 实验验证的技术搭配，比如基因组 + 转录组 + 代谢组联合，再用单细胞测序解析肿瘤微环境，通过细胞 / 动物实验验证靶点功能，让研究证据链更完整。

3. 数据：善用公共数据库，做好交叉验证

临床医生开展多组学研究时，可充分利用 GEO、TCGA 等公共数据库，补充自身样本量的不足；同时对组学数据进行多平台、多队列交叉验证，提升研究结果的可靠性。

4. 图表：可视化呈现，让复杂数据 “一目了然”

顶刊对图表要求极高，多组学研究涉及大量数据，需将复杂的分子通路、技术流程、临床转化路径转化为清晰的示意图（如图 1-6 的设计逻辑），让审稿人快速理解研究核心，提升文章可读性。

5. 临床转化：锚定 “诊疗价值”，让研究有落地可能

多组学研究的最终落脚点是临床转化，需从海量组学数据中筛选出可检测、可应用、可验证的标志物和靶点，或提出个性化治疗、患者分层的策略，让研究不只是“纸上谈兵”，而是有实际的临床应用价值。

总结

郑州大学团队在《Protein & Cell》发表的这篇多组学综述，不仅全面解析了食管鳞癌的高通量组学分子特征，为ESCC 的精准诊断、预后评估和靶向治疗提供了重要依据，更以0 版面费开源发表的模式，让更多研究者能免费获取研究成果，助力食管鳞癌领域的发展。同时，这篇研究的行文和研究逻辑，也为临床医生发表多组学顶刊论文提供了可复制、可借鉴的范本 —— 多组学研究的核心从来不是 “技术的堆砌”，而是以技术为工具，解决临床问题，实现临床转化。

原文DOI：10.1093/procel/pwag005

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