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北京协和医院团队顶刊成果|IF=10.3多组学+孟德尔随机化锁定VTE致病基因,PLAU通路可直接靶向

来源:特诺科研

静脉血栓栓塞症(VTE)是临床沉默的杀手,现有抗凝治疗常伴随出血风险,找到精准致病靶点迫在眉睫。近日,北京协和医院陈倩、张莉团队联合郭叶教授在外科顶刊《International Journal of Surgery》(IF=10.3,开放获取零版面费)发表重磅研究:通过多组学孟德尔随机化SMR)策略,首次从甲基化、转录组、蛋白组三个层面,证实PLAUALOX12LGALS3是中性粒细胞活化相关VTE核心致病基因,其中PLAU存在甲基化上调表达升高蛋白累积的完整致病通路,为血栓靶向治疗提供了全新方向!


文献信息

一、文章信息速览

  • 原标题Potential Neutrophil Activation-Related Pathogenic Genes in Venous thromboembolism: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study

  • 期刊International Journal of SurgeryIF=10.3,外科领域顶刊,开放获取)

  • 关键词:静脉血栓栓塞症(VTE)、中性粒细胞活化、多组学、孟德尔随机化分析、PLAU基因、ALOX12基因、LGALS3基因、共定位分析

二、研究核心目标

筛选调控中性粒细胞活化且与VTE相关的候选基因;

明确这些基因在甲基化、表达、蛋白水平与VTE的因果关系;

验证核心基因的调控通路,为临床干预提供靶点;

建立多组学+孟德尔随机化的临床发文范式。

三、研究核心亮点:从基因筛选到通路验证

这篇顶刊论文的最大价值,在于提供了一套临床问题多组学筛选因果验证机制解析跨队列确认的完整发文框架,特别适合临床医生借鉴:

1. 第一步:精准圈定候选基因库,奠定研究基础

通过GeneCardsNCBI Gene两大数据库,以中性粒细胞活化为关键词,筛选出996个蛋白编码基因,排除冗余后形成核心研究靶点库,确保研究聚焦临床相关基因,避免无意义筛选。

2. 第二步:SMR+共定位,锁定甲基化层面致病位点(图2

GWAS Catalog发现队列(2.5万例VTE患者)中,通过SMR分析筛选出223个与VTE相关的甲基化位点,对应120个基因。经共定位分析(PPH4>0.5)验证,64个位点(30个基因)存在明确因果关联(图2)。


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典型案例:ADORA2A基因的cg25786366位点高甲基化使VTE风险降低10%OR=0.9095%CI=0.84-0.98),而cg04990420位点高甲基化则使风险升高13%,体现了基因位点特异性的调控差异。这些结果在FinnGen复制队列中成功验证,其中P2RY6基因cg03622371位点的保护作用在两队列中方向完全一致。

3. 第三步:转录组验证,PLAU/ALOX12成关键基因(图35

聚焦基因表达层面,发现41个中性粒细胞活化相关基因与VTE风险显著相关,其中22个促栓、19个护栓。10个基因通过共定位验证,PLAUFOS等赫然在列(图3)。


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核心数据:PLAU基因表达升高使VTE风险增加13%OR=1.1395%CI=1.04-1.24),虽在复制队列中未达统计学显著,但风险趋势完全一致(图5A);ALOX12LGALS3表达升高分别使风险增加27%44%,为全新发现的促栓基因。

4. 第四步:蛋白组收尾,构建基因-蛋白致病链(图45

在蛋白层面,21种蛋白与VTE风险相关,12种经共定位验证(图4)。其中PLAU编码的尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)蛋白水平升高,与VTE风险增加显著相关,且在两队列中方向一致(图5B),直接将基因表达与临床表型关联起来。


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5. 第五步:多组学整合,揭示PLAU完整致病通路(图6

通过两步SMR分析,构建出甲基化基因表达蛋白→VTE”的全链条:PLAU基因的cg065212803个位点高甲基化→PLAU表达上调→uPA蛋白累积→VTE风险升高(图6)。


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这种多层面证据收敛的结果,是顶刊最青睐的核心创新点。

四、临床价值:为医生提供科研+临床双重助力

1. 对科研:提供可复制的顶刊发文模板

无需大量临床样本,利用公共GWASQTL数据,通过多组学+孟德尔随机化即可实现顶刊突破,尤其适合临床医生开展转化研究。

2. 对临床:明确全新干预靶点

生物标志物:PLAU甲基化位点可作为VTE风险分层指标,提前识别高风险人群;

治疗靶点:ALOX12LGALS3均为可成药靶点,其抑制剂或可用于VTE预防,避免抗凝药的出血风险。

3. 对转化:推动精准防栓落地

基于PLAU通路的干预策略,可用于肿瘤、骨科大手术等VTE高发人群的精准预防,减少不必要的抗凝治疗。

这项研究诠释了临床问题导向+多组学技术赋能的科研逻辑——VTE治疗困境出发,用多层面遗传证据锁定核心靶点,既解决了基础机制问题,又为临床转化提供了明确方向。

原文DOI: 10.1097/JS9.0000000000004473

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