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南京大学医学院附属鼓楼医院团队IF=10.2顶刊发文|0版面费!多组学+单细胞测序揭秘:AZGP1甲基化激活糖酵解,驱动前列腺癌转移

来源:特诺科研

前列腺癌(PCa)是全球男性第二高发恶性肿瘤,转移是导致患者死亡的首要原因,临床缺乏可靠的无创转移预警标志物,且表观遗传与代谢重编程在转移中的交叉调控机制尚未明确。近日,南京大学医学院附属鼓楼医院团队在《Cellular & Molecular Biology Letters》(IF=10.2,肿瘤领域优质期刊,开源获取)发表重磅研究,整合单细胞测序、bulk转录组、甲基化组多组学技术,结合体内外实验、临床样本验证,首次完整揭示“AZGP1启动子甲基化基因沉默糖酵解激活前列腺癌转移的调控链条,关键结果均有明确图表支撑,为前列腺癌转移的动态监测、预后评估及靶向治疗提供可直接转化的方案


文章信息速览

  • 原标题Methylation-induced silencing of AZGP1 enhances prostate cancer metastasis by stimulating tumoral glycolysis

  • 期刊Cellular & Molecular Biology LettersIF=10.2,肿瘤领域优质期刊,开源获取,Brief Report类型)

  • 关键词:前列腺癌、AZGP1DNA甲基化、糖酵解、肿瘤转移、分子标志物、表观遗传、代谢重编程

研究核心亮点

这篇IF=10.2顶刊论文的成功,核心在于多组学整合+多维度验证的经典发文范式,从筛选验证机制转化形成完整闭环,完全可作为医生发多组学论文的参考模板,5大核心步骤+原文图表,清晰易懂、可复刻:

第一步:单细胞+bulk多组学联合,锁定转移相关核心基因AZGP1(图1) 研究团队先对GSE141445单细胞数据集(36424个细胞)进行预处理、细胞注释,通过Scissor工具结合bulk转录组数据(TCGA-PRAD),精准鉴定出具有转移优势的肿瘤细胞亚群(Met亚群)(图1A); 通过差异表达分析,筛选出9个转移相关候选基因,经TCGA-PRAD队列验证,最终锁定6个核心转移相关基因(MRGs),其中AZGP1与肿瘤转移呈显著负相关(图1BC); 进一步通过单变量、多变量逻辑回归分析,建立前列腺癌转移预测模型,AUC值超70%,证实AZGP1是前列腺癌转移的独立保护因子(图1EF); 另一个独立单细胞数据集(Tuong et al.)验证显示,Met亚群中AZGP1表达显著低于非Met亚群(P=2.289×10⁻⁷),进一步确认AZGP1的核心作用。


转移亚群鉴定及转移预测模型建立(ATSNE图展示Met/Met细胞亚群;B:差异表达分析火山图;C6个核心MRGs在转移与非转移样本中的表达小提琴图;DMRGs与转移相关通路的相关性饼图;E:单/多变量逻辑回归分析图;F:转移预测模型AUC图)

第二步:多队列+临床样本验证,AZGP1低表达与前列腺癌进展、不良预后密切相关(图2) 多中心队列(TCGA-PRADGSE21034DKFZ2018)验证显示,AZGP1低表达与前列腺癌高T分期、N1淋巴结转移、高Gleason评分显著相关(P<0.05)(图2ABC); 生存分析显示,AZGP1低表达患者无进展生存期(PFS)显著缩短,9bulk数据集的meta分析进一步证实AZGP1与患者预后的关联(图2D); 体内实验(裸鼠尾静脉注射、胫骨注射模型)显示,过表达AZGP1可显著降低肺转移、骨转移的荧光强度(P=0.0017P=0.0217)(图2E); 40例临床FFPE样本免疫组化证实,转移组AZGP1H-score显著低于非转移组(P=0.0002),明确AZGP1的临床应用价值(图2FG)。


2 AZGP1表达与前列腺癌进展及预后的关联(A:不同T分期AZGP1表达箱线图;BN0/N1AZGP1表达箱线图;C:不同Gleason评分AZGP1表达箱线图;DAZGP1与患者预后的meta分析森林图;E:体内转移模型荧光成像及定量分析;F:转移与非转移样本AZGP1免疫组化染色图;G:两组样本H-score散点图)

第三步:体内外功能实验,直接验证AZGP1沉默促进前列腺癌转移(图3) 细胞系验证:CCLE数据库及RT-qPCR检测显示,转移性去势抵抗性前列腺癌细胞(PC3DU145)中AZGP1表达最低,原发性细胞(22RV1LNCaP)中表达最高(图3AB); 功能验证:构建AZGP1敲低(22RV1细胞)和过表达(PC3细胞)模型,Transwell实验显示,AZGP1敲低显著增强细胞迁移、侵袭能力,过表达则显著抑制(图3DE); 伤口愈合实验进一步证实,AZGP1表达与细胞迁移能力呈负相关(P<0.05)(图3FG); 蛋白水平验证:Western blot显示,AZGP1敲低可上调N-钙粘蛋白、VEGFAMMP7等转移相关蛋白表达,下调E-钙粘蛋白表达,过表达则呈相反趋势(图3H)。


3 AZGP1对前列腺癌细胞转移表型的调控(ACCLE数据库中不同前列腺癌细胞系AZGP1表达;B4种细胞系AZGP1表达RT-qPCR验证;CAZGP1过表达/敲低效率验证;D22RV1细胞敲低AZGP1后的Transwell实验;EPC3细胞过表达AZGP1后的Transwell实验;FG:伤口愈合实验及定量分析;H:转移相关蛋白Western blot结果)

第四步:代谢机制深挖,AZGP1沉默通过激活糖酵解驱动转移(图4) 单细胞代谢分析显示,AZGP1阴性腔面肿瘤细胞的糖酵解通路显著活化(图4A); TCGA-PRAD队列分析表明,AZGP1表达与糖酵解通路ssGSEA评分呈显著负相关(R=-0.1P=0.03),与LDHAPFKFB3SLC2A1等关键糖酵解酶也呈显著负相关(R=-0.09~-0.23P<0.05)(图4BCD); 功能检测:PC3细胞过表达AZGP1后,乳酸生成量、ECAR(糖酵解速率)显著降低,OCR(线粒体呼吸速率)升高;22RV1细胞敲低AZGP1后则呈相反趋势,明确AZGP1通过抑制糖酵解阻断转移(图4E-J)。


4 AZGP1对前列腺癌细胞糖酵解的调控(AAZGP1阳性/阴性细胞代谢通路富集差异;BAZGP1表达与糖酵解通路ssGSEA评分相关性;CDAZGP1LDHAGP1的表达相关性;E-GPC3细胞过表达AZGP1后乳酸、ECAROCR检测结果;H-J22RV1细胞敲低AZGP1后乳酸、ECAROCR检测结果)

第五步:多组学揭秘调控源头,AZGP1启动子甲基化是其沉默的核心诱因(图5) 甲基化分析:TCGA甲基化与mRNA数据显示,AZGP1启动子cg26429636位点甲基化与基因表达呈强负相关,且淋巴结转移(N1)患者该位点甲基化水平显著高于非转移(N0)患者(P=0.049)(图5AB); 甲基转移酶关联:AZGP1表达与DNMT1DNMT3ADNMT3B三种甲基转移酶表达呈显著负相关(R=-0.3~-0.44P<0.001),且cg26429636位点甲基化水平与这三种甲基转移酶表达呈正相关(图5D-L); MSP验证:甲基化特异性PCR显示,AZGP1高表达的22RV1LNCaP细胞(原发性)中,cg26429636位点呈未甲基化状态;AZGP1低表达的PC3DU145细胞(转移性)中呈高甲基化状态,证实甲基化是AZGP1沉默的关键原因(图5M)。


5 AZGP1启动子甲基化的调控作用(AAZGP1甲基化-表达调控模型及相关性;BN0/N1cg26429636位点甲基化水平箱线图;CM0/M1cg26429636位点甲基化水平箱线图;D-FAZGP1DNMT1DNMT3ADNMT3B的表达相关性;G-Lcg26429636甲基化水平与三种甲基转移酶的表达相关性;M4种细胞系AZGP1启动子MSP检测结果)

总结:多组学发文模板级研究,为前列腺癌转移诊疗+医生发文双重赋能

南京大学医学院附属鼓楼医院团队的这项研究,完美契合中高分期刊临床痛点多组学筛选机制解析多维度验证临床转化的发文逻辑,仅用单细胞+bulk转录组+甲基化组三种多组学技术,结合常规体内外实验、临床样本,就成功拿下IF=10.2的顶刊,且开源0版面费,极大降低了医生发文成本。

研究不仅阐明了AZGP1甲基化通过激活糖酵解驱动前列腺癌转移的核心机制,提供了可临床转化的新型分子标志物(cg26429636位点甲基化)与干预靶点,更给想发多组学论文的医生提供了可直接复刻的范式:无需复杂的多组学组合,聚焦一个核心靶点,用多组学筛选+多队列验证+体内外功能+机制深挖的思路,即可高效产出中高分成果。

原文DOI10.1186/s11658-025-00818-3

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