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中南大学湘雅医院 + 暨南大学联合突破!IF=15.7 顶刊揭秘 NIID 治愈新路径:CRISPR/Cas9 精准切除 GGC 重复序列,0 版面

来源:特诺科研

神经元核内包涵体病NIID)是一种成人起病的神经退行性疾病,由 NOTCH2NLC 基因 5'UTR 区 GGC 重复序列异常扩张导致,临床表现为痴呆、肢体无力、震颤等,严重者可致瘫痪甚至早亡。目前尚无有效治疗手段,仅能对症缓解,且NOTCH2NLC 与同源基因序列相似度极高(<2% 差异),给精准基因编辑带来巨大挑战。

近日,中南大学湘雅医院、暨南大学等联合团队在《Nature Communications》(IF=15.7,神经领域顶刊,开源获取,版面费)发表重磅研究:开发出靶向 NOTCH2NLC 基因的特异性 CRISPR/Cas9 编辑策略,通过双 sgRNA 精准切除异常扩张的 GGC 重复序列,在细胞、患者 iPSC 及转基因小鼠模型中均证实其安全性与有效性,显著逆转疾病相关病理和行为异常。


文章信息速览

原标题Precise excision of expanded GGC repeats in NOTCH2NLC via CRISPR/Cas9 for treating neuronal intranuclear inclusion disease

期刊Nature CommunicationsIF=15.7,神经领域顶刊,开源获取,版面费)

关键词:神经元核内包涵体病(NIID)、CRISPR/Cas9、基因编辑、GGC 重复序列扩张、NOTCH2NLC、多模型验证、脱靶效应、神经退行性疾病

研究背景与临床痛点

治疗困境:NIID 无有效治疗手段,传统药物仅能缓解症状,无法阻断疾病进展,患者预后极差;

技术瓶颈:NOTCH2NLC 与 NOTCH2/NOTCH2NL 家族基因序列相似度极高(<2% 差异),常规基因编辑易产生脱靶效应,破坏正常基因功能;

机制明确但无靶向方案:异常扩张的 GGC 重复序列可翻译为毒性多聚甘氨酸(polyG),形成核内包涵体驱动病理,但缺乏精准靶向重复序列的治疗技术;

重复扩张疾病共性难题:GGC/CCG 重复序列扩张相关疾病达数十种,均面临靶向治疗匮乏的问题,亟需可推广的技术范式。

研究核心亮点

这篇 IF=15.7 顶刊的成功,核心在于 精准靶向设计 多维度验证 临床转化导向” 的研究框架,大关键步骤完美契合神经领域顶刊发表逻辑,关键结果均有图表强力支撑:

1. 第一步:破解同源基因干扰,设计特异性 CRISPR 编辑策略(图 1

核心挑战:NOTCH2NLC 与同源基因 NOTCH2/NOTCH2NL 家族序列高度同源,仅 GGC 重复序列两侧存在 个 mismatch 区域;

设计方案:针对这两个特异性区域设计双 sgRNAsgRNA1+sgRNA6 等组合),避开同源序列,确保编辑特异性;

体外验证:在 HEK293 细胞中,sgRNA1+5sgRNA1+6 组合编辑效率达 33%~40%TA 克隆 + Sanger 测序证实仅靶向 NOTCH2NLC,同源基因无脱靶(图 1H-J);


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关键价值:解决了高同源基因编辑的特异性难题,为同类疾病提供技术参考。

2. 第二步:细胞模型验证,高效降低毒性 polyG 水平(图 2

模型构建:建立稳定表达 NOTCH2NLC-98GGC-GFP 的 HEK293 细胞系(98polyG 细胞),模拟 NIID 的 polyG 毒性表型;

核心结果:CRISPR 编辑后,细胞内聚集型和可溶性 polyG 蛋白水平分别降低 49.0%~51.7% 和 67.6%~78.4%polyG 聚集数量减少 63.1%~69.7%(图 2D-G);

机制确认:PCR 和测序证实 GGC 重复序列成功切除,验证编辑策略对毒性源的直接靶向作用。


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3. 第三步:患者 iPSC 模型验证,逆转转录组异常且无脱靶(图 3

模型构建:从 NIID 患者 PBMC 诱导 iPSC,其 NOTCH2NLC 基因 GGC 重复序列为 113/17 次(正常对照 19/18 次),分化为神经前体细胞(NPCs);

编辑效果:通过 CRISPR 编辑获得 GGC 重复序列删除或修复的 iPSC 克隆,NPCs 转录组图谱更接近正常对照,74.74% 的上调基因和 50.88% 的下调基因恢复正常,富集于神经功能相关通路(图 3C-J);

安全性验证:深度测序(deep-seq)检测 20 个潜在脱靶位点,全基因组测序(WGS)分析 SNPInDel 等,均未发现显著脱靶,编辑后 iPSC 保持正常核型和多能性(图 3A-B)。


图3

4. 第四步:小鼠局部治疗,改善脑内神经病理(图 4

模型选择:采用自主构建的 NIID 转基因小鼠(全身表达 NOTCH2NLC-98GGC),该模型可再现核内包涵体、神经退行等病理特征;

治疗方式:向小鼠纹状体立体定向注射 AAV-PHP.eB 包装的 CRISPR/Cas9 系统(治疗侧)和对照 sgRNA(对照侧);

核心结果:治疗侧 polyG 聚集显著减少,星形胶质细胞激活标志物 GFAP、小胶质细胞标志物 IBA1 表达降低,神经元标志物 NeuN 表达升高,神经炎症和退行表型明显改善(图 4A-D)。


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5. 第五步:小鼠全身治疗,逆转行为异常并延长生存期(图 56

治疗方式:新生 NIID 小鼠经眼后静脉注射 AAV 载体,实现全身递送 CRISPR 系统;

行为学改善:治疗后小鼠在旷场试验中移动距离和时长显著增加,悬丝试验、转棒试验中运动协调能力接近正常对照(图 5B-H);

生存期延长:Kaplan-Meier 分析显示,治疗组小鼠生存期较未治疗组显著延长(图 5I);

分子与病理逆转:大脑皮层 polyG 和 GFAP 水平降低,NeuN 水平升高;转录组分析显示,未治疗组 1789 个上调基因和 334 个下调基因中,58.69% 和 52.10% 恢复正常,富集于神经功能和炎症反应通路(图 6A-I);外周心脏组织的 polyG 水平也降低 79%,转录组异常同步改善。


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总结:多模型验证 + 精准靶向,顶刊论文的核心逻辑

中南大学湘雅医院、暨南大学联合团队的这项研究,完美诠释了临床痛点切入技术瓶颈突破多模型层层验证临床转化落地” 的顶刊研究闭环,其成功关键在于:

靶向精准:聚焦疾病核心致病因子(GGC 重复序列),针对同源基因干扰设计特异性策略,解决领域关键技术难题;

验证全面:从体外细胞患者 iPSC→小鼠局部治疗小鼠全身治疗,覆盖从基础到体内的完整验证体系,结果可信度高;

安全性优先:通过 deep-seqWGS 等多维度验证无脱靶效应,为临床转化奠定基础;

价值延伸:不仅为 NIID 提供潜在治愈方案,还为 FMR1C9ORF72 等重复扩张疾病提供可借鉴的基因编辑范式。

对于医生而言,这类顶刊论文的发文逻辑可直接复用:先明确临床未满足需求,再针对性开发或优化技术,通过体外细胞动物” 的多模型验证体系夯实结论,最后突出临床转化价值。

原文DOI10.1038/s41467-026-68385-5


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